TFE | Stage
Pourquoi faire son TFE/stage au sein du Laboratoire ?
- Accompagnement structuré en étapes (formation technique, suivi itératif, formation à la communication, validation) ;
- Travail réalisé dans un laboratoire avec un système d’assurance qualité ;
- En relation permanente avec de nombreuses entreprises dont des Spin-Off ;
- Large choix depuis la recherche pointue fondamentale jusqu’à la recherche appliquée ;
- Gamme de technologie étendue: depuis les techniques de base jusqu’à la biotechnologie de pointe ;
- Nombreuses collaborations et stages possibles à l’étranger.
Liste des stages et TFE proposés
Pour les étudiants Uliège, la liste est disponible sur l'intranet. Les étudiants extérieurs peuvent trouver la liste ci-dessous :
(Contact : Prof. Haissam Jijakli)
Effet de l’insertion d’un consortium bactérien sur le rendement de la laitue et son microbiote associé dans des systèmes aquaponiques et hydroponiques
Disponibilité : Oui
Promoteur : Pr. Haïssam Jijakli et Pr. Sébastien Massart
Encadrant : Olivier Parisis
Contact : o.parisis@uliege.be
Année académique :2025-2026
Axe : Gestion durable des bioagresseurs
Master : Sciences agronomiques, Chimie et bio-industries
Contexte : Les systèmes de culture hors-sol (aquaponie, hydroponie) représentent une alternative durable et économe en intrants aux pratiques agricoles traditionnelles. Cependant, divers facteurs peuvent limiter la croissance optimale des plantes dans ces milieux.
Les PGPB (plant growth-promoting bacteria), grâce à leurs activités (solubilisation, nitrification, etc.), constituent des alliées prometteuses pour stimuler la croissance des cultures en aquaponie et hydroponie.
Au sein du laboratoire de Phytopathologie intégrée et urbaine, différentes bactéries et consortiums issus de systèmes hors-sol ont déjà été testés sur la laitue (Lactuca sativa var. Lucrecia), avec des résultats encourageants mais variables. L’étude se penchera aussi sur l’impact de ces traitements sur les communautés microbiennes.
Objectifs : Différents objectifs peuvent être poursuivis ;
- Optimisation du traitement (fréquence, quantité, stade, etc) et évaluation de sa robustesse,
- Développement d’un protocole de qPCR pour suivre les PGPB après insertion dans le système,
- Suivi des communautés microbiennes dans le système,
- Recherche des effets de biocontrôle des souches (tests sur boite, développement de pathosystèmes,
- Adaptation du traitement à un système sol (comparaison efficacité en sol vs hors-sol). Ces objectifs peuvent être modifiés/affinés en fonction des affinités de l’étudiant.e. Les objectifs ainsi que le plan de travail peuvent aussi évoluer en fonction de l’avancement de la recherche.
Type d'activités :
- Recherche bibliographique et rédaction.
- Développement de protocoles expérimentaux.
- Travail en laboratoire (microbiologie, biologie moléculaire, préparation de solutions hydroponiques, etc.).
- Travail en serre ou chambre de culture (semis, entretien, mesures).
- Analyses statistiques et bio-informatique.
Compétences nécessaires : Rigueur, sérieux et organisation (gestion du temps). Les connaissances de base en culture hors-sol doivent être maitrisées. Expression orale en anglais. Des expériences pratiques en microbiologie seront appréciées. Esprit de synthèse et d'analyse. Savoir travailler en équipe mais également en autonomie après discussion avec l’encadrant.
Pays : Belgique
Valorisation de déjections animales pour la formulation de solutions bioponiques et leur application en culture hors sol
Année académique : 2025-2026
Promoteur : Haïssam Jijakli
Encadrant : Solène Jarosz
Contact : solene.jarosz@uliege.be
Axe : Gestion durable des bioagresseurs
Master : Agro, PPRN, master en sciences agronomiques)
Contexte : L'étudiant.e interviendra dans le cadre du projet de recherche Européen BIO BOOST PRO, qui a pour objectif de formuler des solutions fertilisantes pour l'agriculture hors-sol à partir de déjections de poisson, de poule et de porc. Sur Gembloux nous travaillons sur les 2 premières sources. Sur cette 2ème année de projet, l'objectif est d'approfondir les connaissances sur les techniques de digestion des matières animales et leur utilisation sur des cultures légumières hors-sol.
Objectifs : Réalisation d'un protocole de digestion pour une des sources animale et du suivi d'une expérimentation agronomique sur une culture courte et évaluation des performances et de la composition de la solution obtenue.
Type d'activités :
- Documentation approfondie des techniques à utiliser.
- Conception de protocole expérimentaux pour la solution bioponique et pour la partie végétale.
- Récolte de résultats, prise de mesures régulières, analyses en laboratoire, entretien des cultures et des systèmes de culture hors-sol.
- Analyse de données, rédaction.
- Restitution du travail auprès des partenaires du projet (anglais)
Compétences nécessaires : Rigueur, sérieux et organisation. Les connaissances de base en culture hors-sol doivent être maitrisées. Expression orale en anglais. Des expériences en production maraichère ou culture hors sol seront appréciées.
Études de plusieurs systèmes de production d'agriculture urbaine, évaluation et comparaison des performances agronomiques des systèmes de production
Disponibilité : Oui
Promoteur : Pr. Haïssam Jijakli
Encadrant : M. Arthur Libault
Contact : Arthur.Libault@uliege.be
Année académique :2025-2026
Axe : Gestion durable des bio-agresseurs
Master : Sciences agronomiques, Sciences et technologies de l’environnement
Contexte : Comparaison des systèmes de productions en agriculture urbaine constitué d'un système aquaponique, hydroponique, pleine terre extérieure, pleine terre sous tunnel et pleine terre sous serre photovoltaïque.
Étude en association avec un autre département pour l'analyse organoleptique des légumes produits.
Objectifs : Comparaison des performances agronomiques et climatiques des systèmes d'agriculture urbaine
Type d'activités : Mise en place des cultures (travail du sol et amendement au besoin), suivis des paramètres environnementaux au quotidien et entretien des cultures. Planification des mesures agronomique. Acquisition des résultats et analyses statistiques via R studio.
Compétences nécessaires : Rigueur dans le travail et motivation demandés. Personne proche du terrain.
Pays : Belgique
Les propositions de stage et de TFE sont disponibles sur l'intranet et touchent aux deux thématiques suivantes:
- Impact des communautés microbiennes dans la pathogenèse
- Impact des communautés microbiennes dans la croissance de la plante et dans sa résistance face aux maladies
(Contact : Prof. Sébastien Massart)
Promouvoir la santé et la vigueur des plantes par l’utilisation rationnelle des biotechnologies
Promoteur : Sébastien Massart
Encadrante et co-promotrice : Fanny Leleux
Année académique : 2024-2025
Contact : sebastien.massart@uliege.be
Axe : Gestion durable des bio-agresseurs
Contexte : Le TFE se réalisera au sein d’une équipe de chercheurs et de techniciens actifs dans la promotion de la santé et de la croissance des plantes par l’étude des interactions entre les microorganismes (le microbiote) et les plantes. Encadré(e) par cette équipe, l’étudiant(e) sera formé(e) à diverses biotechnologies et pourra ensuite les appliquer dans le cadre de bioessais en conditions contrôlées sous la supervision de son encadrante.
Objectifs : L’objectif du mémoire ou du stage consiste à améliorer la santé et la croissance des plantes en utilisant les biotechnologies appropriées (culture de microorganismes, culture in vitro de plantes, techniques moléculaires…).
Le modèle d’étude est le bananier, plante pour laquelle le laboratoire est un centre de référence au niveau mondial. Le projet vise à appliquer des microorganismes bénéfiques sur les plantes en culture in vitro et/ou en serre en vue de stimuler leur vigueur, de les rendre résistance à des maladies et, pour les plantes en culture in vitro, de favoriser leur survie lors de leur transfert en serre.
Type d’activités :
- Culture in vitro de microorganismes bénéfiques et d’agents pathogènes
- Culture in vitro de plantes
- Techniques moléculaires : PCR, RT-PCR, séquençage…
- Bio essais d’inoculation de microorganismes sur les plantes in vitro et/ou en serre
Compétences nécessaires :
- Esprit d’équipe et curiosité
- Polyvalence
Infos pratiques : la formation sera structurée en étapes (formation technique, suivi itératif, formation à la communication, validation) au sein de l’équipe actuellement en place
(Contact : Prof. Haissam Jijakli)
Conception et évaluation d'un produit de biocontrôle microbien pour lutter contre les mildious
Année académique : 2025-2026
Promoteur : Pr. Haïssam Jijakli
Encadrant : Dr. Gilles Stouvenakers
Contact : g.stouvenakers@uliege.be
Axe : Gestion durable des bioagresseurs
Master et Bachelier : Chimie et bio-industries, Sciences agronomiques, Agroécologie, MICA
Contexte : Les systèmes agricoles font face à des restrictions croissantes sur l’usage des pesticides, ce qui limite les solutions disponibles pour lutter contre les maladies des plantes. Une bactérie récemment découverte montre un potentiel prometteur comme agent de biocontrôle des mildious, bien que son efficacité en laboratoire reste difficile à reproduire sur le terrain. Cette étude a pour objectif d’identifier des additifs susceptibles d’améliorer sa survie et sa prolifération face aux stress foliaires. Vous participerez à un projet visant à créer une entreprise produisant des biofongicides microbiens et intégrerez l’équipe dynamique du Laboratoire de Phytopathologie Intégrée et Urbaine.
Objectifs : Le stage/TFE a pour but de développer une formulation efficace d'une nouvelle bactérie non sporulante pour le biocontrôle des mildious foliaires, en suivant un diagramme de développement en plusieurs étapes. Ce processus inclura la vérification de la durée de conservation, la sélection d'additifs protecteurs, l'évaluation de l'absence d'effets adverses des additifs, la validation en conditions de terrain, et la décision finale concernant l'incorporation des additifs dans la formulation commerciale.
Type d'activités : Lutte biologique, phytopathologie, microbiologie, et agronomie.
Développement d’un procédé innovant et optimisé de production et de conservation d’une nouvelle bactérie de biocontrôle des agents phytopathogènes
Année académique : 2025-2026
Promoteurs : Pr Haïssam Jijakli et Pr Philippe Jacques
Encadrant : Dr Gilles Stouvenakers
Contact : g.stouvenakers@uliege.be
Contexte : Vous travaillerez dans le cadre du projet de spin-off devant aboutir à la création d’une entreprise développant des bio-fongicides microbiens. Dans ce type de projet, la validation d’un procédé de production adaptable à échelle industrielle est une étape essentielle et qui conditionne la réussite du projet de commercialisation dans son ensemble. Le projet tire profit de la complémentarité et de l'interdisciplinarité des expertises conjointes du Laboratoire de Phytopathologie Intégrée et Urbaine, du MiPI (Microbial Processes and Interactions) et de l’entreprise THT. Vous travaillez au sein de la faculté de Gembloux Agro-Bio Tech Uliège et profiterez des infrastructures et compétences du laboratoire de Phytopathologie et du MiPI.
Objectifs : Le stage/TFE a pour but de mettre au point un procédé innovant, optimisé, reproductible et économiquement viable de production et de conservation d’une nouvelle bactérie de biocontrôle. Le procédé développé devra répondre aux exigences inhérentes à la production d’un produit de protection des plantes de type microbien. Le milieu de culture sera optimisé par une approche de screening à haut débit, en tenant compte de son impact sur le prix de revient du produit. Un procédé transférable à grande échelle, avec un impact environnemental minimisé, sera développé. Le procédé de conservation de la bactérie est également un élément clé, particulièrement délicat et indispensable, qu’il faudra étudier et développer pour assurer la viabilité biologique et économique du futur produit de protection des plantes. Le stage/TFE s’articulera principalement autour de trois tâches : i) la définition de conditions de culture optimales ; ii) le développement d’un procédé de culture en bioréacteur ; iii) le développement d’un procédé de conservation par lyophilisation.
Type d'activités : Bio-industries, microbiologie, et phytopathologie.
Development of an innovative and optimized process for the production and conservation of a new biocontrol bacterium against phytopathogens
Academic year: 2024-2025
Promotors: Prof. Haïssam Jijakli and Prof. Philippe Jacques
Mentor: Dr. Gilles Stouvenakers
Contact: g.stouvenakers@uliege.be
Context: You will work within the framework of a spin-off project aimed at creating a company developing microbial bio-fungicides. In such projects, the validation of a production process adaptable to an industrial scale is a critical step that determines the success of the overall commercialization project. The project leverages the complementarity and interdisciplinarity of the combined expertise of the Integrated and Urban Phytopathology Laboratory, the MiPI (Microbial Processes and Interactions), and the company THT. You will work within the Faculty of Gembloux Agro-Bio Tech ULiège and benefit from the infrastructure and expertise of the Phytopathology Laboratory and MiPI.
Objectives: The goal of the internship is to develop an innovative, optimized, reproducible, and economically viable process for the production and conservation of a new biocontrol bacterium. The developed process must meet the requirements inherent to the production of a microbial plant protection product. The culture medium will be optimized using a high-throughput screening approach, considering its impact on the product's cost. A process transferable to large-scale production with minimized environmental impact will be developed. The conservation process of the bacterium is also a key and particularly delicate element that must be studied and developed to ensure the biological and economic viability of the future plant protection product. The internship will mainly focus on three tasks: i) defining optimal culture conditions; ii) developing a bioreactor-based culture process; and iii) developing a conservation process through lyophilization.
Type of activities: Bio-industries, microbiology, and phytopathology
Définition d’un itinéraire technique pour le sapin de Noël par le développement de deux bio-solutions innovantes
Promoteur : Haïssam JIJAKLI
Encadrant : Thomas DEMORTIER
Contact : t.demortier@uliege.be
Année académique : 2024-2025
Axe : Gestion durable des bio-agresseurs
Master : Chimie et bio-industriesGestion des forêts et des espaces naturelsSciences agronomiquesSciences et technologies de l’environnement
Contexte : Ce travail de fin d'étude est proposé dans le cadre du projet X-tree. X-tree est un projet de recherche entre 3 partenaires : Gembloux Agro-Bio Tech (centre de recherche), APEO (production de bio-herbicide à base d’huiles essentielles) et Elicir (production de biostimulant à base d’extrait végétal). Ce projet a pour objectif de développer un nouvel itinéraire de culture pour les sapins de Noël grâce à deux bio-solutions. En participant au développement des produits et à l’étude de leur mode d’application, les recherches menées à Gembloux proposeront une alternative aux méthodes de culture actuelles. Cette technologie innovante répond à la demande des producteurs de diminuer les intrants chimiques et l’utilisation intensive d’engrais en lien avec les régulations européennes. Le TFE se réalisera dans le Laboratoire de Phytopathologie Intégrée et Urbaine (LPIU) de la faculté de Gembloux Agro-Bio Tech en collaboration avec les sociétés APEO et Elicir.
Objectifs : Le but de ce TFE est de contribuer aux recherches sur l’application de deux bio-solutions dans la culture du sapin de Noël (modèle : Abies nordmanniana). Afin d’y arriver, plusieurs sous-objectifs ont été fixés. Le sujet du TFE sera choisi au début de la période de travail en fonction de l’avancée du projet ainsi que des intérêts de l’étudiant.e parmi la liste de tâches ci-dessous.
-Etude des modes d’action du biostimulant Elicir
-Définition des conditions d’applications du biostimulant Elicir
-Mesure de l’effet du biostimulant Elicir sur A. nordmanniana
-Evaluation de l’effet du biostimulant Elicir sur les besoins en engrais de la culture
-Etude du spectre d’action du bio-herbicide APEO
-Définition des conditions d’applications de l’herbicide APEO
-Mesure de l’efficacité du bio-herbicide APEO (en serre, en champ)
-Evaluation de l’effet de l’utilisation combinée des produits
-Etude de l’impact des produits sur le microbiote du sol
Type d'activités
1.Recherches bibliographiques et contact avec les producteurs
2.Développement de protocoles expérimentaux
3.Manipulations au laboratoire : a) Préparation des formulations : b) Suivi de la stabilité, c) Etude des paramètres physico-chimiques, d) Réalisation d’expériences sur sol et/ou plantes modèles
4.Expériences en serre : a) Semis et culture de plantes modèles, b) Pulvérisation des produits, c) Mesures d’efficacité
5.Coordination d'essais en champ : a) Définition de protocoles, b) Relevé des mesures
6.Traitement statistique et interprétation des résultats
Compétences nécessaires
-Bonne gestion du temps
-Esprit de synthèse et d'analyse
-Autonomie
Contraintes / Spécificités /Infos pratiques
-Recherche appliquée avec débouchés concrets et positifs.
-Relation avec des entreprises
-Objectifs et plan de travail à préciser en fonction de l’avancement du projet de recherche
-Objectifs et plan de travail personnalisables en fonction des intérêts de l’étudiant
Pays : Belgique
Optimisation de la formulation de bioherbicides innovants et développement d’une méthodologie de tests d’efficacité en conditions contrôlées
Année académique : 2025-2026
Promoteur : Haïssam Jijakli
Encadrant : Emma Voisin, Thomas Demortier
Contact : e.voisin@apeosolutions.com
Axe : Gestion durable des bioagresseurs
Master : Tous, hautes écoles compris
Contexte : L’utilisation excessive d’herbicides chimiques conventionnels provoque de nombreuses préoccupations, tant au niveau environnemental que sanitaire. APEO Solutions est une spin-off qui développe des bioherbicides plus durables à base d’huiles essentielles. Dans le cadre du projet PROFOIL, APEO vise à développer une formulation bioherbicide pour le marché professionnel. Le TFE étudiera l’efficacité des prototypes de formulation sur les adventices plus couramment présentes dans les cultures cibles.
Objectifs :
-Déterminer les adventices principales rencontrées dans les cultures cibles ;
- Etablir des protocoles de culture de ces plantes en conditions contrôlées ;
-Etablir un protocole d’évaluation de l’efficacité des formulations sur chaque plante ;
- Optimiser la formulation selon les résultats obtenus en serre.
Type d'activités :
-Identification des adventices (bibliographie et au champ) ;
- Mise au point et rédaction de protocoles ;
-Culture des plantes et réalisation d’essais en conditions contrôlées ;
- Mesures de l’efficacité des formulations (visuelle, numérique, massique, …) ;
-Travail de laboratoire (formulation, mesures de stabilité, …).
Amélioration d’un biofongicide à base d’huiles essentielles contre Cercospora beticola sur betteraves
Promoteur : Pr. Haïssam Jijakli
Co-promoteur et encadrant : Dr. Clément Burgeon, contact : cburgeon@uliege.be
Axe: Gestion durable des bioagresseurs
Contexte : La cercosporiose, causée par Cercospora beticola est la plus grande menace pour la production de betteraves sucrières. Afin de lutter contre celle-ci, des pesticides chimiques synthétiques ont été fréquemment utilisés. Cependant, leur utilisation soulève des préoccupations en matière de santé, d'environnement et de résistance. Des alternatives sont donc en cours de développement. Parmi celles-ci se trouvent les biofongicides à base d’huiles essentielles. Au cours des précédentes années de recherches réalisées sur ce projet, des prototypes de biofongicides ont permis d’obtenir des résultats prometteurs pour le contrôle de la cercosporiose sur betterave. Ces prototypes doivent maintenant être optimisés afin d’augmenter leur efficacité davantage.
Objectif : Ce TFE s’inscrit dans un projet collaboratif entre Gembloux Agro-Bio Tech et la société APEO, qui travaille sur la mise au point d’une alternative durable et innovante aux fongicides conventionnels. L’objectif est de développer un produit biosourcé à base d’huiles essentielles, destiné à lutter efficacement contre la cercosporiose (Cercospora beticola) sur betterave.
Le travail poursuivra plusieurs finalités :
- Optimiser une formulation déjà existante et bien aboutie, afin d’en renforcer encore l’efficacité fongicide tout en s’assurant de l’absence de phytotoxicité sur la betterave.
- Tester in vivo (directement sur betteraves) le prototype actuel et ses nouvelles versions, afin d’identifier la formulation la plus prometteuse.
- Contribuer à l’essor de solutions phytosanitaires durables, en valorisant les huiles essentielles comme levier d’innovation pour une agriculture plus respectueuse de l’environnement.
Type d’activité
- Reproduction des symptômes de la cercosporiose sur betterave : Culture de C. beticola en laboratoire, Préparation d’une suspension de spores infectieuses, Inoculation du pathogène sur des jeunes plants de betterave
- Amélioration du prototype de formulation : Adaptation éventuelle des co-formulants utilisés et des doses de ces derniers ainsi que de la matière active, Etude de la stabilité du produit, Etude de sa rhéologie
- Essais d’efficacité des prototypes de formulation sur le pathosystème (ie. C. beticola inoculé sur betterave) : Mise en place d’un dispositif expérimental de traitements (concentration du produit, nombre d’application, etc.), Préparation des formulations expérimentales d’huiles essentielles, Application des formulations sur plantes infectées par C. beticola, Suivi et évaluation de l’efficacité de contrôle des bio-fongicides à base d’huiles essentielles contre C. beticola
- Traitement statistique et interprétation des résultats
Compétences nécessaires : Bonne gestion du temps. Esprit de synthèse et d'analyse. Savoir travailler en équipe mais également en autonomie après discussion avec encadrant
Contraintes/Spécificités/Infos pratiques
- Accompagnement structuré en étapes (formation technique, suivi itératif, formation à la communication, validation)
- Recherche appliquée avec débouchés concrets et positifs
- Les objectifs ainsi que le plan de travail peuvent évoluer en fonction de l’avancement de la recherche
- Le TFiste sera amené à travailler en étroite collaboration avec un autre TFiste travaillant sur un autre pathosystème mais pour lequel les objectifs du TFE seront similaires.
Autres informations pratiques :
Le TFE se réalisera dans le laboratoire de phytopathologie intégrée et urbaine de la faculté de Gembloux Agro-Bio Tech (GxABT). Parmi les objectifs du laboratoire, nous retrouvons le développement de produits innovants à base d'huiles essentielles comme alternatives aux produits phytopharmaceutiques de synthèse. Le TFE sera réalisée en collaboration étroite avec APEO, spin-off du laboratoire de phytopathologie intégrée et urbaine. L’étudiant bénéficiera donc également de l’expertise des chercheurs travaillant au sein de cette entreprise.Pour la réalisation du travail, l’étudiant.e aura donc accès aux installations de l’axe phytopathologie de GxABT, c’est-à dire : bureau, laboratoires, chambre de cultures, chambres climatiques, et serres.
Études de modes d’action d’un bioherbicide
Année académique : 2025-2026
Promoteur : Haïssam Jijakli
Encadrant : Nicolas Mathot
Contact : Nicolas.mathot@uliege.be
Axe : Gestion durable des bioagresseurs
Master en Sciences agronomiques, Chimie et bio-industries ou Sciences et technologies de l’environnement. Sujet accessible à des TFE d'étudiants de hautes écoles également.
Contexte : Avec l'augmentation des préoccupations environnementales et des impacts négatifs associés aux herbicides chimiques traditionnels, il est crucial de développer des solutions alternatives plus sûres et durables. Parmi ces options figurent les bioherbicides, qui sont des produits de lutte contre les mauvaises herbes provenant d'organismes vivants, incluant les produits naturels qu'ils produisent au cours de leur croissance.
Dans le cadre du projet européen CONSERWA, visant à développer et évaluer de nouvelles stratégies de gestion durable des mauvaises herbes à l’aide de solutions naturelles, un bioherbicide à base d’extraits de plantes et de fermentats bactériens est en développement (https://conserwa.eu/).
Pour pouvoir mieux comprendre et expliquer l’origine de l’efficacité du produit, des études de modes d’action sont nécessaires. Ces analyses permettront d’identifier les mécanismes physiologiques et biochimiques ciblés par le bioherbicide, ainsi que leurs conséquences sur la croissance et le développement des plantes.
Objectif : Étudier les modes d’action de formulations herbicides sur plantes.
Type d'activités : Cultures de plantes et réalisation d’essais en conditions contrôlées (phytotrons).
Travail de laboratoire comprenant la réalisation de tests physiologiques et biochimiques (intégrité membranaire, mesures de fluorescence chlorophyllienne, dosage des pigments et production de ROS).
Collecte et analyse de données (par exemple, liées à la phytotoxicité).
Amélioration de la solubilité et de la biodisponibilité des métabolites secondaires de Cynara cardunculus L. par des stratégies éco-compatibles
Année académique : 2025-2026
Promoteur : Pr. Haïssam Jijakli
Encadrant : Amine Yazidi
Contact : ML.Yazidi@doct.uliege.be
Axe : Gestion durable des bioagresseurs
Master : Agro, PPRN, Chimie, Hautes écoles
Contexte : L’usage intensif d’herbicides chimiques représente une menace majeure pour les écosystèmes et la durabilité des systèmes agricoles, en raison de leurs effets sur la santé humaine, l’environnement et l’émergence de résistances. Pour répondre à ces enjeux, la recherche se tourne de plus en plus vers des alternatives naturelles issues de métabolites secondaires de plantes.
Cynara cardunculus L., une espèce méditerranéenne, est particulièrement riche en composés bioactifs (acides phénoliques, flavonoïdes, sesquiterpènes lactones) dont plusieurs présentent une activité herbicide prometteuse. Ces molécules sont étudiées dans le cadre d’un projet doctoral visant à développer des bioherbicides naturels et durables.
Cependant, un obstacle majeur à leur application réside dans leur faible solubilité dans l’eau et leur biodisponibilité réduite, limitant ainsi leur efficacité sur le terrain. Le TFE proposé se concentre sur cette problématique en explorant des stratégies de formulation éco-compatibles (solvants verts, co-formulants naturels, émulsions, encapsulation) afin d’augmenter la solubilité, la stabilité et l’efficacité des métabolites secondaires de C. cardunculus L.
Objectifs : Ce TFE s’inscrit dans un projet de recherche visant à valoriser les métabolites secondaires de C. cardunculus L. comme base de nouveaux bioherbicides. L’objectif principal est de développer et de tester des formulations permettant d’améliorer la solubilité et la biodisponibilité de ces molécules. Le travail poursuivra plusieurs finalités : (i) Explorer différentes stratégies de formulation éco-compatibles pour améliorer la solubilité des extraits. (ii) Tester la stabilité et la compatibilité des formulations obtenues. (iii) Évaluer l’efficacité biologique des formulations sur plantes modèles (germination et croissance). (iv) Contribuer au développement de solutions de biocontrôle innovantes, respectueuses de l’environnement et basées sur des ressources végétales.
Type d’activités : Préparation des extraits et formulations. Extraction des métabolites secondaires de C. cardunculus L. Développement de formulations éco-compatibles (solvants verts, émulsions, encapsulation). Caractérisation physico-chimique. Tests de solubilité et de stabilité. Analyses chromatographiques (UHPLC-MS). Mise en place de tests de germination et de croissance. Application et suivi de l’efficacité herbicide des formulations. Analyse et interprétation des résultats. Traitement statistique des données. Discussion et valorisation des résultats dans la perspective de solutions applicables en biocontrôle
Compétences nécessaires :
- Intérêt pour le travail de laboratoire (extraction, formulation, bio-essais)
- Capacité d’analyse et esprit critique
- Autonomie dans la gestion des expériences, tout en coopérant avec l'encadrant
- Rigueur scientifique et aptitude à synthétiser les résultats
Contraintes / Spécificités / Infos pratiques
- Le projet fait partie d’un travail de thèse plus large sur les bioherbicides issus de C. cardunculus L.
- Les étapes du TFE seront accompagnées par un encadrement régulier (technique, méthodologique et rédactionnel).
- Les objectifs et le plan expérimental pourront être adaptés selon les résultats obtenus.
Autres informations pratiques
Le TFE sera réalisé au sein du laboratoire de phytopathologie intégrée et urbaine de la faculté de Gembloux Agro-Bio Tech (ULiège, Belgique).
L’étudiant(e) disposera des infrastructures de l’axe phytopathologie, comprenant bureaux, laboratoires, chambres de culture, chambres climatiques et serres, afin de mener à bien l’ensemble des activités prévues.
Pays : Belgique
Réinventer la lutte contre les adventices : un bioherbicide sélectif formulé à partir d’huiles essentielles
Promoteur : Haïssam Jijakli
Encadrant : Clément Burgeon (cburgeon@uliege.be)
Axe: Gestion durable des bioagresseurs
Contexte
Le sujet de TFE/stage s'inscrit dans le cadre d'un projet de recherche nommé LIPOIL. Ce projet multidisciplinaire impliquant différents laboratoires de Gembloux Agro-Bio Tech (MiPI, LPIU, LCMN, LBMI) et la société APEO vise à développer un nouveau bioherbicide sélectif à base d'huiles essentielles ciblant spécifiquement les plantes dicotylédones chez les particuliers. L’enjeu est de répondre au manque actuel de solutions herbicides sélectives contre ces plantes, particulièrement face aux restrictions croissantes sur les matières actives imposées par les autorités.
Ce projet est par essence multidisciplinaire et collaboratif :
- le laboratoire MiPI développe des lipopeptides biosurfactants destinés à être associés aux huiles essentielles dans les formulations,
- la société APEO travaille sur la conception et l’optimisation des formulations, avec l’appui d’une formulatrice dédiée,
- le laboratoire LPIU développe et teste les formulations en conditions contrôlées et en serre,
- les laboratoires LBMI et LPIU contribuent à l’étude des modes d’action.
Objectif
Le travail aura pour but de :
- Développer et caractériser des formulations au laboratoire, en étroite collaboration avec la formulatrice du projet, en respectant les critères requis pour ce type de produit (stabilité, sécurité, conformité réglementaire),
- Étudier l’efficacité herbicide de ces formulations en conditions contrôlées (labo, serre) sur dicots, en veillant à l’absence d’effet sur monocots,
- Bioguider le développement des formulations par les modes d’action supposés des substances actives, étudiés :
o en laboratoire (effets morphologiques, physiologiques, biochimiques),
o en serre (efficacité in vivo),
o et potentiellement in silico (modélisation moléculaire, interactions avec des cibles biologiques).
Le/la TFiste travaillera donc en priorité sur la formulation, mais pourra également contribuer à l’étude des modes d’action (in vivo et in silico), en fonction de l’avancée du projet.
Type d’activité
Les activités prévues ci-dessous constituent une liste non exhaustive et illustrent les principaux types de travaux envisagés dans le cadre du stage/TFE :
- Recherche bibliographique approfondie (sélectivité dicots vs monocots, modes d’action des huiles essentielles et lipopeptides),
- Développement, optimisation et caractérisation de formulations associant huiles essentielles et co-formulants dont les biosurfactants,
- Suivi de la stabilité via différents paramètres physico-chimiques,
- Étude des propriétés d’étalement des formulations sur les feuilles (angle de contact, tension de surface),
- Tests d’efficacité en conditions contrôlées (labo, serre) sur modèles dicots/monocots,
- Étude des modes d’action (in vivo et éventuellement in silico),
- Traitement statistique et interprétation des résultats
Compétences nécessaires
- Bonne gestion du temps
- Esprit de synthèse et d'analyse
- Savoir travailler en équipe mais également en autonomie après discussion avec encadrant
Contraintes/Spécificités/Infos pratiques
- Accompagnement structuré en étapes (formation technique, suivi itératif, formation à la communication, validation)
- Recherche appliquée avec débouchés concrets et positifs
- Les objectifs ainsi que le plan de travail peuvent évoluer en fonction de l’avancement de la recherche
Autres informations pratiques :
Le TFE se réalisera dans le laboratoire de phytopathologie intégrée et urbaine de la faculté de Gembloux Agro-Bio Tech (GxABT). Parmi les objectifs du laboratoire, nous retrouvons le développement de produits innovants à base d'huiles essentielles comme alternatives aux produits phytopharmaceutiques de synthèse.
Le TFE sera réalisée en collaboration étroite avec APEO, spin-off du laboratoire de phytopathologie intégrée et urbaine. L’étudiant bénéficiera donc également de l’expertise des chercheurs travaillant au sein de cette entreprise.
Pour la réalisation du travail, l’étudiant.e aura donc accès aux installations de l’axe phytopathologie de GxABT, c’est-à dire : bureau, laboratoires, chambre de cultures, chambres climatiques, et serres.
Développement d’un bioherbicide formulé à partir d’huiles essentielles : évaluation phytotoxique et analyse des modes d’action des composés actifs
Année académique : 2025-2026
Promoteur : Haïssam Jijakli
Encadrant : Sofiene Ben kaab
Contact : sofiene.benkaab@uliege.be
Axe : Gestion durable des bioagresseurs
Master : Agro, PPRN, chimie, etc et hautes écoles
Contexte : Les extraits végétaux y compris les huiles essentielles sont étudiés depuis de nombreuses années pour leurs propriétés fongicides et bactéricides en médecine humaine et vétérinaire. Plus récemment, leurs applications en protection des cultures ont été mise en évidence pour leurs propriétés fongicides mais également leur propriété herbicide (Ben kaab et al 2025). Le LPIU est leader dans le domaine de la recherche pour la protection des cultures et APEO, son partenaire privé, est devenu incontournable pour le développement de produits à base de ces huiles essentielles. Le TFE se réalisera dans le Laboratoire de Phytopathologie Intégrée et Urbaine (LPIU) de la faculté de Gembloux AgroBio Tech en collaboration avec la société APEO.
Objectifs :
Ce projet de fin d'étude portera sur l'optimisation d’une formulation herbicide pour le secteur des particuliers (Home & Garden) avec comme matière active une huile essentielle.
Le TFE aura trois objectifs principaux :
- Optimiser la stabilité et la finesse des formulations ;
- Évaluer l’efficacité des différentes formulations en serre ;
- Étudier le mode d’action de la matière active du produit sur la plante.
Type d’activités
- Optimisation de la stabilité et de la finesse de la formulation
- Préparation des formulations
- Évaluation de la tenue des émulsions
- Détermination de la taille des gouttes
- Évaluation de l’efficacité du bioherbicide en serre
- Pulvérisation des différentes formulations en serre
- Évaluation de la phytotoxicité des différentes formulations
- Étude du mode d’action de la matière active du produit sur la plante
- Dosage de la matière active dans la plante cible
- Dosage des enzymes cibles
- Recherche bibliographique
- Traitement statistique et interprétation des résultats
Compétences nécessaires
-Bonne gestion du temps
-Esprit de synthèse et d'analyse
-Autonomie
Contraintes / Spécificités /Infos pratiques
Les objectifs et le plan de travail seront précisés en fonction de l’avancement du projet de recherche.
Contribution à l’étude des modes d’action fongicides d'huiles essentielles sur le phytopathogène Venturia inaequalis
Promoteur : Pr. Jijakli Haïssam
Co promoteur : Ir. Dal Maso Simon
Contact : l.vandenberghe@apeosolutions.com
Encadrant : Ir. Van den Berghe Léopold
Axe : Gestion durable des bioagresseurs
Contexte : Le TFE se réalisera dans le Laboratoire de Phytopathologie Intégrée et Urbaine (LPIU) de la faculté de Gembloux Agro-Bio Tech (GxABT) en étroite collaboration avec la spin-off APEO. Cette entreprise, créée en janvier 2021, a pour objectif de trouver, de développer, d'enregistrer et de commercialiser des produits phytopharmaceutiques basés sur des substances d’origine biologiques.
Pour la réalisation du travail, l’étudiant.e aura accès aux installations de l’axe phytopathologie de GxABT, c’est-à-dire : bureau et un laboratoire de microbiologie.
Objectif : Ce TFE s’intègre dans un projet intitulé TAVOIL visant à développer un produit fongicide biosourcé à base d’huiles essentielles contre la tavelure du pommier (V. inaequalis). L’objectif général du projet est de proposer une alternative aux fongicides de synthèse présentant un impact sur l’environnement et sur la santé humaine réduit comparé à ces derniers.
L’étudiant devra remplir plusieurs objectifs spécifiques :
- Recherche bibliographique sur l’étude des modes d’action fongicides des huiles essentielles
- Mise en place de protocoles biochimiques permettant d’investiguer les effets d’huiles essentielles sur les cellules de inaequalis
- Application des protocoles développés pour l’obtention de données expérimentales rigoureuses
Type d'activité :
- Réalisation d’une recherche bibliographique rigoureuse
- Création d’équations de recherche exhaustives
- Lecture annotée de contenus scientifiques
- Rédaction d’un état de l’art sur base des lectures réalisées
- Culture de inaequalis en laboratoire
- Développement et mise en application de protocoles d’étude de modes d’action fongicides
- Étude de la perméabilité membranaire
- Étude de l’intégrité des parois cellulaires
- Quantification de la production de ROS de cellules stressées
- Étude de la respiration cellulaire de cellules stressées
- Traitement statistique et interprétation des résultats obtenus
Compétences nécessaires :
- Esprit de synthèse et d'analyse
- Curiosité scientifique
- Créativité
- Capacité à travailler en équipe ainsi qu’en autonomie
Contraintes/Spécificités/Infos pratiques
- Accompagnement structuré en étapes (formation technique, suivi itératif, formation à la communication, validation)
- Recherche appliquée avec débouchés concrets et positifs
- Les objectifs ainsi que le plan de travail peuvent évoluer en fonction de l’avancement de la recherche
Contribution à la formulation d'un biopesticide à base d'huiles essentielles pour le contrôle de Venturia inaequalis sur pommier
Promoteur : Pr. Jijakli Haïssam
Co promoteur : Ir. Dal Maso Simon
Contact : l.vandenberghe@apeosolutions.com
Encadrant : Ir. Van den Berghe Léopold
Axe : Gestion durable des bioagresseurs
Contexte : Le TFE se réalisera dans le Laboratoire de Phytopathologie Intégrée et Urbaine (LPIU) de la faculté de Gembloux Agro-Bio Tech (GxABT) en étroite collaboration avec la spin-off APEO. Cette entreprise, créée en janvier 2021, a pour objectif de trouver, de développer, d'enregistrer et de commercialiser des produits phytopharmaceutiques basés sur des substances d’origine biologiques.
Pour la réalisation du travail, l’étudiant.e aura accès aux installations de l’axe phytopathologie de GxABT, c’est-à-dire : bureau et un laboratoire de microbiologie.
Objectif : Ce TFE s’intègre dans un projet intitulé TAVOIL visant à développer un produit fongicide biosourcé à base d’huiles essentielles contre la tavelure du pommier (V. inaequalis). L’objectif général du projet est de proposer une alternative aux fongicides de synthèse présentant un impact sur l’environnement et sur la santé humaine réduit comparé à ces derniers.
L’étudiant devra remplir plusieurs objectifs spécifiques :
- Optimiser la formulation d’un biofongicide prototype afin d’augmenter son efficacité ainsi que sa stabilité au cours du temps.
- Étudier en laboratoire des paramètres spécifiques à l’efficacité de formulations biofongicides
- Évaluer l’efficacité in vivo (c-à-d. sur le pathosystème) des prototypes développés.
Type d'activité :
- Amélioration de la formulation
- Formulation de biofongicides prototypes
- Étude de divers paramètres physico-chimiques en laboratoire
- Étude de la stabilité des formulations
- Reproduction des symptômes de la tavelure sur pommier en conditions contrôlées
- Culture de inaequalis en laboratoire
- Préparation de suspensions de spores infectieuses
- Inoculation du pathogène sur de jeunes plants de pommier
- Essais d’efficacité des prototypes de formulation sur le pathosystème
- Préparation des formulations prototypes à base d’huiles essentielles
- Applications des formulations sur la pathosystème
- Évaluation de l’efficacité des formulations prototypes dans le contrôle de inaequalis via l’analyse numérique de photographies des symptômes de la maladie
- Traitement statistique et interprétation des résultats
Compétences nécessaires :
- Esprit de synthèse et d'analyse
- Curiosité scientifique
- Créativité
- Capacité à travailler en équipe ainsi qu’en autonomie
Contraintes/Spécificités/Infos pratiques
- Accompagnement structuré en étapes (formation technique, suivi itératif, formation à la communication, validation)
- Recherche appliquée avec débouchés concrets et positifs
- Les objectifs ainsi que le plan de travail peuvent évoluer en fonction de l’avancement de la recherche
De nombreuses possibilités de stages et de travaux de fin d'étude (Master thesis) sont proposées en lien avec les thématiques suivantes:
- Enquête épidémiologique de terrain sur les phytovirus (combinant de l'échantillonnage en parcelle et des techniques de pointe au laboratoire, comme le séquençage haut-débit)
- Etude de l'écologie des virus à l'interface entre les écosystèmes sauvages et les parcelles cultivées
- Etude en conditions contrôlées de la génétique des populations des phytovirus et de leur évolution en fonction de contraintes biotiques et abiotiques
- Caractérisation biologique de nouveaux virus identifiés par séquençage haut-débit par des essais en serre et des études épidémiologiques
- Utilisation des outils de l'intelligence artificielle pour prédire les risques d'émergence des phytovirus
(Contact : Prof. Sébastien Massart)
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